上个世纪90年代， 该校被列为自治区民族教育改革试点校。承担“三语”教学实验任务， 经过多年的努力， 探索出了“精通本民族语言文字的基础上，掌握汉语文，同时学好一门外语”的新路子。不仅使通辽蒙中形成了自己独特的教学风格，也为“三语”教学在全区乃至全国的推广起到推动作用。积极实施素质教育。在有针对性地对学生进行思想道德教育，组织学生开展主题班会、参与心理咨询、模拟法庭、行为规范模拟等教育活动的基础上，充分发挥第二课堂的作用，挖掘潜力，发挥特长，开设了丰富多彩的课外活动。在科技活动中，四百余名学生的小制作、小发明荣获区级、国家级大奖共120多项，2001 年， 在第六届全国青少年生物与环境科学实践活动中，科技小组以《大青沟自然保护区探索活动》课题荣获优秀活动三等奖。2002 年5月，在中央电视台第十套节目主办的全国异想天开小发明比赛中，学生自己设计发明的作品分获一、二、三等奖。在全面实施素质教育的基础上，通辽蒙中的教育教学成绩稳步上升， 每年的高考升学率始终列自治区民族中学之首， 上重点线和重点大学的比例始终保持80％左右，2001 年， 高考升学率94．3％，2002 年、2003 年、2004 年升学率均为100％， 其中通辽蒙中于1999 年获得全区蒙授理科状元之后，2004 年又获得了全区蒙授文科状元。

    坚持“以人为本”的教学理念。该校为了让学生都能安心上学，避免辍学，学校采取了减免学费的措施。每年都有200多名学生的学费得到减免，减免金额达20万左右。1998 年学校女工委成立了“三八献爱心组织”，捐钱捐物，来帮助少数民族贫困学生。学校设立了特困生助学基金， 拿出一部分钱用来奖励品学兼优的贫困学生。

    50年来，通辽蒙中以高水平的管理、高质量的教学、高素质的教师、优异的成绩，赢得了社会的认可，学校知名度与日俱增，不仅是市内，甚至其他盟市的民族学生也慕名而来。目前外盟市的学生已占学生总数的27％。多年来，通辽蒙中为国家培养了万余名少数民族人才， 是当之无愧的“科尔沁民族英才的摇篮”。